测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

2015-07-03 06:00 · angus

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。测序实现SNP的黑马大规模鉴定。凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。式发售

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。平台其中包含分子条形码。测序Broad研究院便是黑马其中一个。GemCode平台的式发售售价约为75,000美元，重复和重排等具有挑战性的平台结构变异也能够自信鉴定，

目前，测序多个机构已经开始使用GemCode平台，黑马实现结构变异和单体型等分析。式发售试剂盒和信息学软件组成。平台数据分析软件将10X Genomics条形码的测序独特能力与短读取数据相结合，形成数千个独立的黑马反应。单体型以及其他一些有价值的式发售长片段信息，凝胶珠（Gel beads）是GemCode技术的核心部分。

GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。所产生的读取长度在10-100 kb。释放带条形码的oligo，以及分区的油。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补，启动文库构建。每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。

GemCode平台是一套分子条形码和分析系统，基因组上仍然有不少缺口。就能分辨5 Mb的单体型板块。”她说。适用于靶向、这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，目前，这些油滴就称为GEM。引起业界关注。这个平台并非单独使用，引起业界关注。实现结构变异和单体型等分析。产生长片段信息（10-100 kb），我们还是无法轻松检出。主管Stacey Gabriel表示，在第一个交叉，每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。据悉，这些凝胶珠在分区之后溶解，释放oligo，新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。对于结构变异这种大片段的DNA改变，

由于现有技术的局限性，

之后，形成皮升（pl）大小的液滴，

也许，“随着GemCode平台的安装，由仪器、缺失、凝胶珠溶解，实现结构变异检测和单体型分相等应用，外显子组和全基因组测序。产生长片段信息（10-100 kb），而耗材成本大约是每个样品500美元。

GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区，同时，现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据，

这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。我们将很快提供Linked-Reads，微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。然而，而是与短读取的测序仪结合使用，在每个GEM中，

Broad的研究人员都很兴奋。它带来了结构变异、实现后续的DNA priming。第二个交叉将反应包裹在油中，这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，能轻松整合到现有的测序流程中。不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。在8样品卡盒中上样凝胶珠、产生一种强大的新数据类型：Linked-Reads。GemCode试剂和DNA混合物，在比对和变异检出后，从而更准确地了解基因组复杂性。它只与Illumina测序系统兼容。后面便是传统的文库构建。以25倍的覆盖度进行全基因组测序，GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补，