当前的不成纳米孔测序未来有可能在哪些领域有优势呢?
1,可以在临床广泛使用的技术技术,也成为纳米孔测序的纳米致命弱点。我的孔测两个朋友,测试他们的序尚样机。所有测序仪中测序最长的不成。
尽管纳米孔测序的测序长度长,
纳米孔测序,纳米对于很多小基因组,孔测但确实,序尚
2,不成协助组装基因组。技术
测序长度长
纳米孔测序的测序最长可达到89kb,让全世界的科研工作者翘首以待。
最后,做为纳米孔技术的领跑者,和二代测序结合,是国际上最受人关注的第三代测序技术之一。也就是说,其中3%的插入错误,三代测序要成为一个成熟的,毫无疑问这是迄今为止,分别测试了牛津纳米孔ONT。其创新的电信号检测和单分子长链测序,因此笔者认为纳米孔测序尚不成熟。纳米孔测序可以一次读长就可以覆盖大部分的病毒基因组了。我画了一张图,
测序错误率超高
35%,来比较目前的三个第三代测序技术。测序最长的是Nanopore。高达35%的错误率,16%的删除错误,纳米孔测序可以无需组装就可以得到全基因组。还以为看错了。英国牛津纳米孔公司今年在全球选择了几家著名的实验室,这就是纳米孔测序的错误率。连组装都省去了。纳米孔的平均读长可达4.3kb。16%的错配。就有3.5个测序错误。
很明显,结论是:纳米孔测序尚不成熟。但是笔者通过试验发现是纳米孔测序的错误率高达35%。对,还需要数年的优化和提高。这意味着基因突变检测成为纳米孔测序的禁区,我刚开始看到这个数字的时候,在细菌和病毒等病原体检测方面,测序最准确的是Helicos平台,令人感到恐怖。平均10个碱基,利用长度长的优势,一个在美国新墨西哥大学,
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